Transportados a un puesto remoto fortificado, Thomas y sus compañeros adolescentes del Claro se encuentran en problemas después de descubrir un complot diabólico de la misteriosa y poderosa organización WCKD. Con la ayuda de un nuevo aliado, los Habitantes organizan un atrevido escape hacia el Abrasador, un paisaje desolado lleno de obstáculos peligrosos y plagado de Cranks infectados por virus. La única esperanza de los Habitantes del Claro puede ser encontrar la Mano Derecha, un grupo de luchadores de la resistencia que puede ayudarlos a luchar contra la WCKD.